Rahvaliiga A ja B tasandil loositi paaridesse 1/16-finaali jõudnud meeskonnad.

1/16-finaalide loosimisel võeti veel arvesse regionaalset printsiipi, kuid alates 1/8-finaalidest toimub juba vabaloos.

Kuna Narva linna meistrivõistlustel teisele kohale tulnud Paemurru SK loobus, siis sai A tasandil 32 hulka ka Kohtla-Nõmme, kes oli paremuselt viies neljanda koha omanik.

1/16-finaalide pidamise tähtajaks on 18. september. 1/8-finaalide loosimine toimub 19. septembril.

A tasandi 1/16-finaalid:

1. Rasmus Värki Jalgpallikool - JK Terav Sats
2. FC Zapoos - FC Lebo Ülesanne
3. IAFA Partizan - Sisehoovi Legendid
4. JK Kuusalu Legendid - Padise Valla Jalgpalliklubi
5. JK Rapla Lokomotiiv - IAFA Inter Tallinn
6. Mariae Moha - FC Puhkus Mehhikos
7. Viimsi Lõvid - FK Odratakkel
8. Kohtla-Nõmme - FC Peipsi
9. JK Kabala - FC Molycorp Silmet
10. Rakvere Wiswald - Narva Õlitööstus
11. FC Audru - FC Peedu
12. FC Taritu - Orissaare Sport
13. Tori Põrgulised - FC Salme
14. Rõngu United - Põltsamaa Sport
15. Tartu Taara - Äksi JK
16. Puhja JK - Tartu JK Welco III

B tasandi 1/16-finaalid:

1. arvato FC - FC Error United
2. Jalgpallihaigla - Anija United
3. FC Tallinna Wolves - Enamasti Pealekata
4. SEB - FC Rauapainutajad
5. Nabala Kohalikud Koprad - Rumori Calcio II
6. Kiili JK - FC ulasabaT
7. JSK Fööniks - Untitled United
8. Ruudulised Tiigrid - Fortuna
9. FC Haaslava - FC Teisipäeva Jalkakutid
10. Väimela - sk Räpina
11. Laheda SK - FC Valga Kuradid
12. Paduvere SK Illi - FC Vasuma
13. JK Pingipoisid - Rõngu City
14. FC Jõgeva Wolves II - Antsla
15. Kõpu Dynamo - Käina United
16. FC Emmaste - JK KÄÄPA